شناسایی ژنتیکی و طبقه بندی آرتمیای ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

پایان نامه
چکیده

در این تحقیق، تنوع ژنتیکی جمعیت آرتمیا اورمیانا و آرتمیا فرانسیسکانا ی موجود در ایران با استفاده از 5 جفت آغازگر ریزماهواره ای (af-b105tail، af-a136، apdq03tail، apdq04tail و apdq05tail) ویژه ی آرتمیا فرانسیسکانا و آرتمیا پارتنوژنتیکا بررسی شد. از 50 سیست آرتمیا ی هر یک از این دو جمعیت به صورت انفرادی dna با روش گلوله ی داغ استخراج شد. با استفاده از آغازگر ها ی پنج گانه و از طریق واکنش زنجیره ای پلی مراز (pcr)و ، dna ژنومی تکثیر شد. محصولات pcr با موفقیت انجام و فرآورده ها ی حاصل بر روی ژل پلی اکریل آمید غیر واسرشته ساز 6% الکتروفورز و با نیترات تقره رنگ آمیزی گردیدند. تمامی جایگاه ها چند شکل بودند. میانگین تعداد آلل ها و محتوا ی اطلاعات چند شکلی ( pic) برای جمعیت آرتمیا فرانسیسکانا و آرتمیا اورمیانا به ترتیب برابر با 3، 5428/0 و 5/2، 3833/0 بود. در آرتمیا اورمیانا تمامی جایگاه ها در تعادل هاردی - واینبرگ قرار داشتند در حالی که در آرتمیا فرانسیسکانا تنها جایگاه af-a136 در تعادل هاردی – واینبرگ قرار داشت. میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار برای آرتمیا فرانسیسکانا و آرتمیا اورمیانا به ترتیب 6209/0 و 4531/0 محاسبه شد. دندروگرام فیلوژنتیکی در داخل جمعیت ها براساس فاصله ی ژنتیکی و با استفاده از روش upgma (جفت گروه ها ی غیر وزنی) ترسیم گردید. نتایج تحقیق حاضر نشان داد که ریز ماهواره ها می توانند به عنوان ابزار ی مناسب برای بررسی تنوع زیستی در حیوانات استفاده شوند. لذا می توان با برنامه ها ی صحیح مدیریتی از انقراض این ذخایر ژنتیکی با ارزش جلوگیری به عمل آورد. کلمات کلیدی: ریز ماهواره، آرتمیا، تنوع ژنتیکی، هتروزیگوسیتی، چند شکلی . abstract this study, genetic variation of artemia urmiana and artemia franciscana populations were using, five microsatellite markers (af-b105tail, af-a136, apdq03tail, apdq04tail and apdq05tail) from artemia franciscana and artemia parthenogenetica. dna of samples extracted from 50 cysts artemia urmiana and artemia franciscana populations individually by hot shot method. the polymerase chain reactions (pcr) were successfully done with all primers and then the productes were electrophoresed in 6% (undenaturing) page and stained with silver nitrate. hence, all alleles were found polymorphic. allelic and polymorphic information content (pic) averages for artemia urmiana and artemia franciscana populations were 3, 0.5428 , 2.5 and 0.3833, respectivly. artemia urmiana was in hardy-weinberg equilibrium (hwe) but artemia franciscana was only in af-a136 locous in hardy-weinberg equilibrium (hwe). the average expected heterozygosity for artemia franciscana and artemia urmiana were estimated as 0.6209 and 0.4531 , respectivly. the phylogeny denderograms based on the distance matrix, distances were drown using unweighted pair-group method by an arithmetic average (upgma) for inside population. on the base of findings of this research, microsatellite markers could be an useful tool for screening of biodiversity at animals, thus could be preserved from extinction by optimal breeding and management programs. keywords: microsatellite, artemia, genetic diversity, heterozygosity, polymorphism

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

بررسی روابط ژنتیکی تعدادی از انگورهای وحشی و زراعی ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

به منظور بررسی روابط ژنتیکی مابین 72 رقم انگور زراعی و 65 ژنوتیپ وحشی استان آذربایجان غربی و کردستان از 19 جفت آغازگر ریزماهواره هسته‌ای استفاده شد. از مجموع 19 آغازگر تکثیر یافته مجموعاً 163 آلل در ارقام زراعی با متوسط 6/8 آلل و 153 آلل در ژنوتیپ‌های وحشی انگور با میانگین 05/8 آلل تکثیر شد. هتروزیگوتی مورد انتظار از 70/0 در انگورهای زراعی تا 73/0 در ژنوتیپ‌های وحشی متغیر بود. میزان هتروزیگوتی م...

متن کامل

ارزیابی تنوع ژنتیکی جمعیت‌های بومی یونجه ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ESTs

To determine genetic diversity among some Iranian local varieties of alfalfa, six geographically diverse populations including: Bami, Rahnani, Nikshahri, Yazdi, Hamadani (from Isfahan), Hamadani (from Shiraz) along with Ranger, an American commercial variety, were evaluated using a set of 24 EST-SSR primers developed from cDNA library of Medicago truncatula and three microsatellite loci, identi...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت اسب کرد ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

در این تحقیق با استفاده از شش نشانگر ریزماهواره (HMS07, HMS03, HMS02, HMS06, ASB02, ASB23) تنوع ژنتیکی درون جمعیت 52 نمونه اسب کرد اصیل که از استان­های کردستان، کرمانشاه، ایلام، آذربایجان غربی، اصفهان، کرمان و همدان به‌طور تصادفی نمونه‌گیری شده‌اند، بررسی شد. از نمونۀ خون­های گرفته‌شده DNA به روش نمکی بهینه یافته استخراج شد. واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) برای افزونش قطعه‌های شش جایگاه ریزماهوار...

متن کامل

ارزیابی تنوع ژنتیکی جمعیت‌های بومی یونجه ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ESTs

To determine genetic diversity among some Iranian local varieties of alfalfa, six geographically diverse populations including: Bami, Rahnani, Nikshahri, Yazdi, Hamadani (from Isfahan), Hamadani (from Shiraz) along with Ranger, an American commercial variety, were evaluated using a set of 24 EST-SSR primers developed from cDNA library of Medicago truncatula and three microsatellite loci, identi...

متن کامل

شناسایی و ارزیابی تنوع ژنتیکی ارقام سیب زمینی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ای

به دلیل افزایش تعداد ارقام سیب زمینی و اهمیت تولید غده های بذری با خلوص ژنتیکی بالا، شناسایی دقیق و نیز ارزیابی ژنتیکی ارقام از فعالیت های مستمر در تحقیقات مربوط به اصلاح سیب زمینی محسوب می شود. برای دست یابی به یک روش قابل اعتماد جهت شناسایی 28 رقم سیب زمینی، کارایی 10 نشانگر ریزماهواره ای که در مطالعات سایر محققین چند شکلی مناسبی نشان داده بودند، بررسی شد. جفت آغازگرهای ریزماهواره مورد استفاد...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم کشاورزی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023